,假陽性率較低。但對基因組非常復(fù)雜的鹽酸核生物(如人)
,則因工作量太大
,表達(dá)的序列所占百分比較低(僅5%左右),價值不大
。
cDNA微點隈雜交(cDNA microarray hybridization)
是指將cDNA克隆或cDNA的PCR產(chǎn)物以高度的列陣形式排布并結(jié)合于固相支持物上(如:尼龍膜或活化的載玻片)以微點陣
,然后用混合的不同DNA探針與微點陣上的DNA進行雜交。再利用熒光
、化學(xué)發(fā)光
、共聚焦顯微鏡等技術(shù)掃描微點陣上的雜交信息。它比差異雜交技術(shù)的效率高
、速度快
、成本低,適用于大規(guī)模的分析
。已成商品問世
。其缺點是無法克服保守的同源序列及重序?qū)﹄s交信息的干擾。
寡核苷酸微點隈雜交(oligonucleotide microarray hybridization)
是在特殊的固相支持物上原位合成寡核苷酸
,使它共價結(jié)合于支持物表面
,與平均長度為20-50nt的混合RNA或cDNA探針進行雜交,以提高雜交的特異性和靈敏度
。應(yīng)用共聚焦顯微鏡可檢測跨越三個數(shù)量級的雜交信息
。適用于低豐度mRNA的檢測,以區(qū)分基因家族不同成員的差異表達(dá)特征
,或鑒定同一轉(zhuǎn)錄在不同組織和細(xì)胞中的選擇性剪接
。但有工作量較大、成本較高
、速度較慢等弱點
。
液相雜交(solution hbridization)
指使變性的待測核酸單鏈與放射笥核素標(biāo)記的已知的酸單鏈(探針)在溶液中保溫,使之形成雜交復(fù)合物
。反應(yīng)結(jié)束后
,用羥磷灰石法或酶解法將未被雜交的單鏈和雜交雙鏈分開,然后結(jié)膈后在雜妝分子中的探針量
,就可推算出被測的核酸量
。
遞減雜交(subtractive hybridizatio)
是利用兩種來源一致而功能不同的組織細(xì)胞提取mRNA(或逆轉(zhuǎn)錄成的cDNA),在一定的條件下以過量的驅(qū)動mRNA或cDNA與測試的單鏈cDNA或mRNA進行液相雜交,通過羥基磷灰石柱層析篩選除去兩者間同源的雜交體。經(jīng)多輪雜交策選
、除去兩者之間相同的基因成分
,保留特異表達(dá)的目的基因或工基因片段。以后者篩選cDNA文庫
,可獲得特異表達(dá)的目的基因cDNA全長序列
。
核酸原位雜交
用特定標(biāo)記的已知順序核酸作為探針與細(xì)胞級或組織切片中核酸進行復(fù)性雜交并對其實行檢測的方法,稱為核酸原位雜交(nucleic acid hybridization in situ)
。用來檢測DNA在細(xì)胞核或染色休上的分布,與細(xì)胞內(nèi)RNA進行雜交以研究該組織細(xì)胞中特定基因表達(dá)水閏;還用于細(xì)胞
、組織中有無特異性菌
、病毒檢測的研究。
該法的優(yōu)點是特異性高
,可定位;能在成分復(fù)雜的組織中進行單一細(xì)胞的研究而不受同一組織中其他成分的影響;不需要從組織中提取核酸
,對于組織中含量極低的靶序列有*的敏感性;并可完整地保持組織與細(xì)胞的形態(tài)。因此被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)生物學(xué)的研究
,如基因定位
、基因制失,基因易位
、特異基因整合部物色檢測等研究
。近年來由定性發(fā)展到定量,方法更為完善
。
DNA分子克隆技術(shù)(也稱基因克隆技術(shù))
在體外將DNA分子片段與載體DNA片段連接
,轉(zhuǎn)入細(xì)胞獲得大量拷貝的過程中DNA分子克隆(或基因克?div id="d48novz" class="flower left">
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。其基本步驟包括:制備目的基因→將目的基因與載體用限制性內(nèi)切酶切割和連接,制成DNA重組→導(dǎo)入宿主細(xì)胞→篩選
、鑒定→擴增和表達(dá)
。載體(vecors)在細(xì)胞內(nèi)自我復(fù)制,并帶動重組的分子片段共同增殖
,從而產(chǎn)生大量的DNA分子片段
。主要目的是獲得某一基因或NDA片段的大量拷貝,有了這些與親本分子*相同的分子克隆
,就可以深入分析基因的結(jié)構(gòu)與功能
,隨著引入的DNA片段不同,有兩種DNA庫
,一種是基因組文庫(genomic library),另一種是cDNA庫